计算函数#

Arrow 支持在可能具有不同类型输入的情况下进行逻辑计算操作。

标准的计算操作由 pyarrow.compute 模块提供,可以直接使用:

import pyarrow as pa
import pyarrow.compute as pc
a = pa.array([1, 1, 2, 3])
pc.sum(a)
<pyarrow.Int64Scalar: 7>

分组聚合函数会引发异常,需要通过 pyarrow.Table.group_by() 方法使用。有关更多详细信息,请参阅 Grouped Aggregations

标准计算函数#

许多计算函数支持数组(分块或不分块)和标量输入,但有些会强制要求使用其中一种。例如,sort_indices 要求其唯一的输入必须是数组。

以下是一些简单示例:

import pyarrow as pa
import pyarrow.compute as pc
a = pa.array([1, 1, 2, 3])
b = pa.array([4, 1, 2, 8])
pc.equal(a, b)
<pyarrow.lib.BooleanArray object at 0x7fb15740a620>
[
  false,
  true,
  true,
  false
]
x, y = pa.scalar(7.8), pa.scalar(9.3)
pc.multiply(x, y)
<pyarrow.DoubleScalar: 72.54>

这些函数不仅仅能进行元素级的运算。下面是对表格排序的示例:

import pyarrow as pa
import pyarrow.compute as pc
t = pa.table({'x':[1,2,3],'y':[3,2,1]})
i = pc.sort_indices(t, sort_keys=[('y', 'ascending')])
i
<pyarrow.lib.UInt64Array object at 0x7fb15740a2c0>
[
  2,
  1,
  0
]

分组聚合#

PyArrow 支持通过 pyarrow.Table.group_by() 方法对 pyarrow.Table 进行分组聚合。该方法将返回一个分组声明,可以应用哈希聚合函数:

import pyarrow as pa
t = pa.table([
      pa.array(["a", "a", "b", "b", "c"]),
      pa.array([1, 2, 3, 4, 5]),
], names=["keys", "values"])
t.group_by("keys").aggregate([("values", "sum")])
pyarrow.Table
keys: string
values_sum: int64
----
keys: [["a","b","c"]]
values_sum: [[3,7,5]]

在上一个示例中传递给 aggregate 方法的 "sum" 聚合是 hash_sum 计算函数。

可以通过将它们提供给 aggregate 方法同时执行多个聚合操作:

import pyarrow as pa
t = pa.table([
      pa.array(["a", "a", "b", "b", "c"]),
      pa.array([1, 2, 3, 4, 5]),
], names=["keys", "values"])
t.group_by("keys").aggregate([
   ("values", "sum"),
   ("keys", "count")
])
pyarrow.Table
keys: string
values_sum: int64
keys_count: int64
----
keys: [["a","b","c"]]
values_sum: [[3,7,5]]
keys_count: [[2,2,1]]

还可以为每个聚合函数提供聚合选项,例如我们可以使用 CountOptions 来更改如何计算空值:

import pyarrow as pa
import pyarrow.compute as pc
table_with_nulls = pa.table([
   pa.array(["a", "a", "a"]),
   pa.array([1, None, None])
], names=["keys", "values"])
table_with_nulls.group_by(["keys"]).aggregate([
   ("values", "count", pc.CountOptions(mode="all"))
])
pyarrow.Table
keys: string
values_count: int64
----
keys: [["a"]]
values_count: [[3]]

表和数据集拼接#

pyarrow.Tablepyarrow.Dataset 都支持通过 pyarrow.Table.join()pyarrow.Dataset.join() 方法进行连接操作。

这些方法接受一个右侧的表或数据集,该数据集将与初始数据集进行连接,并使用两个实体中的一个或多个键来执行连接操作。

默认情况下执行 left outer join,但可以请求支持的任何连接类型。

基本的连接可以通过提供要连接的表和连接应执行的键来执行。

import pyarrow as pa

table1 = pa.table({'id': [1, 2, 3],
                   'year': [2020, 2022, 2019]})

table2 = pa.table({'id': [3, 4],
                   'n_legs': [5, 100],
                   'animal': ["Brittle stars", "Centipede"]})

joined_table = table1.join(table2, keys="id")

结果将是通过在 id 键上执行左外连接来创建的新表,该新表是将 table1table2 连接起来的结果。

joined_table
pyarrow.Table
id: int64
year: int64
n_legs: int64
animal: string
----
id: [[3,1,2]]
year: [[2019,2020,2022]]
n_legs: [[5,null,null]]
animal: [["Brittle stars",null,null]]

我们可以通过将它们传递给 join_type 参数来执行其他类型的连接,例如 full outer join

table1.join(table2, keys='id', join_type="full outer")
pyarrow.Table
id: int64
year: int64
n_legs: int64
animal: string
----
id: [[3,1,2,4]]
year: [[2019,2020,2022,null]]
n_legs: [[5,null,null,100]]
animal: [["Brittle stars",null,null,"Centipede"]]

还可以提供额外的连接键,以便在两个键上进行连接,而不是一个。例如,我们可以向 table2 添加一个 year 列,以便我们可以连接 ('id', 'year')

table2_withyear = table2.append_column("year", pa.array([2019, 2022]))
table1.join(table2_withyear, keys=["id", "year"])
pyarrow.Table
id: int64
year: int64
n_legs: int64
animal: string
----
id: [[3,1,2]]
year: [[2019,2020,2022]]
n_legs: [[5,null,null]]
animal: [["Brittle stars",null,null]]

其中只有 id=3year=2019 的条目有数据,其余的将为空。

pyarrow.Dataset.join() 也有相同的功能,因此您可以获取两个数据集并将它们连接起来:

import pyarrow.dataset as ds

ds1 = ds.dataset(table1)
ds2 = ds.dataset(table2)

joined_ds = ds1.join(ds2, keys="id")

结果数据集将是一个包含连接数据的 pyarrow.dataset.InMemoryDataset

joined_ds.head(5)
pyarrow.Table
id: int64
year: int64
n_legs: int64
animal: string
----
id: [[3,1,2]]
year: [[2019,2020,2022]]
n_legs: [[5,null,null]]
animal: [["Brittle stars",null,null]]

使用表达式进行过滤#

表格和数据集都可以通过布尔 Expression 进行过滤。

可以从 pyarrow.compute.field() 开始构建表达式。然后,可以将比较和转换应用于一个或多个字段,以构建您关心的过滤器表达式。

大多数计算函数可用于对 field 执行变换。

例如,我们可以构建一个过滤器,找到列 "nums" 中所有偶数行。

import pyarrow.compute as pc
even_filter = (pc.bit_wise_and(pc.field("nums"), pc.scalar(1)) == pc.scalar(0))

备注

过滤器通过执行数字和 1 之间的按位与操作来找到偶数。由于 1 在二进制形式中表示为 00000001,只有最后一位设置为 1 的数字才会从 bit_wise_and 操作返回非零结果。这样我们就识别出了所有奇数。鉴于我们感兴趣的是偶数,然后我们检查 bit_wise_and 返回的数字是否等于 0。只有最后一位是 0 的数字才会使 num & 1 的结果返回 0,由于所有最后一位是 0 的数字都是 2 的倍数,我们将仅过滤出偶数。

一旦我们有了过滤器,我们可以将其提供给 pyarrow.Table.filter() 方法,以便仅过滤出匹配的行:

table = pa.table({'nums': [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10],
                  'chars': ["a", "b", "c", "d", "e", "f", "g", "h", "i", "l"]})
table.filter(even_filter)
pyarrow.Table
nums: int64
chars: string
----
nums: [[2,4,6,8,10]]
chars: [["b","d","f","h","l"]]

多个过滤器可以使用 &|~ 来连接,以执行与、或和非操作。例如,使用 ~even_filter 实际上将过滤出所有奇数:

table.filter(~even_filter)
pyarrow.Table
nums: int64
chars: string
----
nums: [[1,3,5,7,9]]
chars: [["a","c","e","g","i"]]

可以通过将 even_filterpc.field("nums") > 5 过滤器结合起来,构建一个找到所有大于 5 的偶数的过滤器:

table.filter(even_filter & (pc.field("nums") > 5))
pyarrow.Table
nums: int64
chars: string
----
nums: [[6,8,10]]
chars: [["f","h","l"]]

数据集可以通过 pyarrow.dataset.~Dataset.filter() 方法进行类似的过滤。该方法将返回 pyarrow.dataset.~Dataset 实例,当实际访问数据集的数据时,它将惰性地应用过滤器。

dataset = ds.dataset(table)
filtered = dataset.filter(pc.field("nums") < 5).filter(pc.field("nums") > 2)
filtered.to_table()
pyarrow.Table
nums: int64
chars: string
----
nums: [[3,4]]
chars: [["c","d"]]

用户定义函数#

PyArrow 允许定义和注册自定义计算函数。然后,这些函数可以通过它们注册的函数名在 Python 以及 C++(可能还包括其他包装Arrow C++ 的实现,如 R arrow 包)中调用。

UDF(用户定义函数)支持仅限于标量函数。标量函数是指在数组或标量上执行逐元素操作的函数。通常,标量函数的输出不依赖于参数值的顺序。请注意,这类函数大致对应于 SQL 表达式中使用的函数,或 NumPy 通用函数

要注册 UDF(用户定义函数),需要定义函数名、函数文档、输入类型和输出类型。使用 pyarrow.compute.register_scalar_function() 进行注册,

import numpy as np

import pyarrow as pa
import pyarrow.compute as pc

function_name = "numpy_gcd"
function_docs = {
      "summary": "Calculates the greatest common divisor",
      "description":
         "Given 'x' and 'y' find the greatest number that divides\n"
         "evenly into both x and y."
}

input_types = {
   "x" : pa.int64(),
   "y" : pa.int64()
}

output_type = pa.int64()

def to_np(val):
    if isinstance(val, pa.Scalar):
       return val.as_py()
    else:
       return np.array(val)

def gcd_numpy(ctx, x, y):
    np_x = to_np(x)
    np_y = to_np(y)
    return pa.array(np.gcd(np_x, np_y))

pc.register_scalar_function(gcd_numpy,
                           function_name,
                           function_docs,
                           input_types,
                           output_type)

用户定义函数的实现总是需要名为 ctx (如上例中所示)的第一个上下文参数,它是 pyarrow.compute.UdfContext 的一个实例。这个上下文暴露了多个有用的属性,特别是 memory_pool(),用于在用户定义函数的上下文中进行分配。

您可以使用 pyarrow.compute.call_function() 直接调用用户定义的函数:

pc.call_function("numpy_gcd", [pa.scalar(27), pa.scalar(63)])
<pyarrow.Int64Scalar: 9>
pc.call_function("numpy_gcd", [pa.scalar(27), pa.array([81, 12, 5])])
<pyarrow.lib.Int64Array object at 0x7fb15715ed40>
[
  27,
  3,
  1
]

处理数据集#

更一般地,用户定义函数可以在任何可以通过其名称引用计算函数的地方使用。例如,它们可以使用 pyarrow.dataset.Expression._call() 在数据集的列上调用。

考虑一个实例,数据在一个表格中,我们想要计算一列与标量值 30 的最大公约数(GCD)。我们将重用上面创建的“numpy_gcd”用户定义函数:

import pyarrow.dataset as ds
data_table = pa.table({'category': ['A', 'B', 'C', 'D'], 'value': [90, 630, 1827, 2709]})
dataset = ds.dataset(data_table)
func_args = [pc.scalar(30), ds.field("value")]
dataset.to_table(
            columns={
                'gcd_value': ds.field('')._call("numpy_gcd", func_args),
                'value': ds.field('value'),
                'category': ds.field('category')
            })
pyarrow.Table
gcd_value: int64
value: int64
category: string
----
gcd_value: [[30,30,3,3]]
value: [[90,630,1827,2709]]
category: [["A","B","C","D"]]

请注意,ds.field('')._call(...) 返回 pyarrow.compute.Expression。传递给这个函数调用的参数是表达式,而不是标量值(注意 pyarrow.scalar()pyarrow.compute.scalar() 之间的区别,后者产生一个表达式)。当投影操作执行时,这个表达式会被评估。

投影表达式#

在上述示例中,我们使用了一个表达式来向表中添加一个新列(gcd_value)。向表中添加新的、动态计算的列被称为“投影”(projection),并且在投影表达式中可以使用哪些类型的函数是有限制的。投影函数必须为每个输入行发出一个单一的输出值。该输出值应完全从输入行计算得出,且不应依赖于任何其他行。例如,我们上面用作示例的“numpy_gcd”函数是可用于投影的有效函数。而“累积求和”函数将不是有效函数,因为每个输入行的结果取决于之前的行。“删除空值”函数也将无效,因为它不为某些行发出值。